Das Mädchen, das durch die Zeit sprang worum geht es?

Der Anime beginnt mit einer Traumszene der 17-jährigen Makoto Konno.
In dieser spielt sie wie gewöhnlich zusammen mit ihren Freunden Chiaki
Mamiya und Kōsuke Tsuda Baseball.
Mit beiden ist Makoto eng befreundet, alle drei sind im selben Alter.
Aus ihrem Traum wird sie unsanft durch einen vom Himmel fallenden Wecker
geweckt und muss feststellen, dass sie abermals verschlafen hat. So
eilt sie wie gewöhnlich mit ihrem Fahrrad zur Schule und schafft es,
gerade noch rechtzeitig anzukommen. In der Schule wird sie zusammen mit
ihren Freunden und restlichen Klassenkameraden überrascht, einen Test
schreiben zu müssen. Wie gewöhnlich schneidet Makoto sehr schlecht dabei
ab, während Chiaki gleich aufgibt und anfängt zu schlafen. In der Folge
wird sie durch ihren Schulalltag begleitet, bei dem ihr immer wieder
etliche Missgeschicke passieren.

Als sie im Vorbereitungsraum einen Stapel von Dokumenten ablegen
soll, wird sie vom Schatten einer sich im Raum befindenden Person
erschreckt und fällt dabei auf ein wie eine Walnuss
aussehendes Objekt. Dieses überträgt ihr die Fähigkeit für Zeitsprünge
in die Vergangenheit. Noch ahnungslos begibt sich Makoto mit dem Rad auf
den Heimweg. Bei ihrer Fahrt reißt jedoch der Bowdenzug
für die Bremsen und so rast sie ungebremst den Abhang hinunter, an
dessen Ende sich die Schranken für die herannahenden Züge bereits
geschlossen haben. Viel zu schnell geworden, um noch abspringen zu
können, prallt sie gegen die Schranken und fliegt mit ihrem Rad auf die
Fahrbahn, wo in diesem Moment der Zug eintrifft.

Eigentlich tot, findet sich Makoto jedoch umgehend einige Zeit vor
dem Unfall am oberen Ende des Hanges wieder vor und erhält eine neue
Chance, ihr Unglück abzuwenden. Bald darauf entdeckt sie jedoch die
Fähigkeit, bei größeren Zusammenstößen oder Stürzen in der Zeit
zurückzureisen. Sie nutzt diese Fähigkeit dazu, peinliche Erlebnisse
rückgängig zu machen, pünktlich in der Schule zu sein und gute Noten zu
schreiben. Mit der Zeit jedoch verändern sich die Dinge zum Schlechten,
da sie bemerkt, dass ihre Eingriffe in der Zeit für andere Menschen
ebenfalls Auswirkungen haben.

Sie verkuppelt Kōsuke mit einem Mädchen, das ihm seine Liebe gesteht.
Als Chiaki Makoto ebenfalls seine Liebe erklärt, ist sie zunächst
erschrocken und versucht, dieses Geständnis zunächst durch mehrfaches
Zurückversetzen der Zeit wieder rückgängig zu machen, akzeptiert es
jedoch danach und entwickelt ebenfalls Gefühle für ihn. Währenddessen
leiht sich Kōsuke Makotos Fahrrad und gelangt an denselben Abhang wie
Makoto, rast auf die Bahnlinie zu und stürzt wegen der kaputten Bremsen
auf die Schienen. Makoto verbraucht ihren letzten Sprung, um Kōsuke zu
retten, springt jedoch an die falsche Zeitstelle, und Kōsuke stirbt
vermeintlich.

Plötzlich ist Kōsuke jedoch wieder lebendig, und Makoto begegnet
Chiaki. Es stellt sich heraus, dass Chiaki ein Junge aus der Zukunft ist
und dass es ein Missgeschick seinerseits war, durch welches Makoto die
Fähigkeit zu Zeitreisen erhalten hat. Er ist selbst in der Zeit
zurückgereist, um ein Bild zu sehen, das es in seiner Zukunft nicht mehr
gibt. Das Bild ist gerade in Restaurierung. Jedoch kann Chiaki nicht
mehr in die Zukunft zurückkehren, weil er durch die Rettung von Kōsuke
die feststehende Anzahl seiner Zeitsprünge aufgebraucht hat. Chiaki
verschwindet nach dieser Erklärung. Makoto erkennt jedoch, dass sie
durch Chiakis Sprung selbst wieder einen Sprung übrig hat. Sie reist in
die nahe Vergangenheit zurück und erzählt dort dem Chiaki aus dieser
Gegenwart, dass sie von allem weiß. Auch Chiaki hat durch von Makotos
Sprung wiederum seinen letzten Sprung zurückerhalten und kehrt mit den
Worten „Ich werde in meiner Zukunft auf dich warten“ in seine eigene
Gegenwart zurück.