Evangelion:1.11 – You are (not) alone (Animefilm) worum geht es?

Der 14-jährige Schüler Shinji Ikari kommt auf Wunsch seines Vaters
Gendō nach Neo Tokyo-3. Auf dem Weg dorthin gerät er mitten in den Kampf
des Militärs gegen eine riesenhafte Kreatur, die als der „vierte Engel“
bezeichnet wird. Shinji wird in das Hauptquartier der geheimen UN-Organisation
NERV gebracht, die von seinem Vater geleitet wird. Er ist als Pilot für
den Evangelion Einheit 01 vorgesehen, einer humanoiden
Universalkampfmaschine, die speziell für den Kampf gegen die Engel
entwickelt und gebaut wurde. Nachdem er sich zunächst weigert, willigt
Shinji schließlich doch ein, EVA-01 zu steuern, hat dem Engel jedoch
kaum etwas entgegenzusetzen. Als der Kampf bereits zugunsten des
Angreifers entschieden scheint, gerät der Evangelion plötzlich außer
Kontrolle und besiegt während seines Amoklaufs den Engel, der sich daraufhin selbst zerstört.

Nach dem Kampf wird Shinji aufgrund des sehr distanzierten und
zerrütteten Verhältnisses zu seinem Vater von der NERV-Offizierin Misato
Katsuragi aufgenommen. Die Eingewöhnung in seine neue Umgebung fällt
ihm sehr schwer; an seiner neuen Schule hat Shinji kaum Kontakte zu
seinen Mitschülern. Von seinem Klassenkameraden Tōji Suzuhara wird er
gar verprügelt, da dessen kleine Schwester bei Shinjis Kampf gegen den
Engel schwer verletzt wurde.

Im Kampf gegen den fünften Engel missachtet Shinji einen Befehl zum
Rückzug und greift den Gegner stattdessen frontal an. Obwohl es ihm
gelingt, den Engel im letzten Moment zu besiegen, wird Shinji von
Misato, die bei NERV seine Vorgesetzte ist, für seinen Ungehorsam zur
Rede gestellt und gerügt. Er läuft davon und wandert ziellos umher, bis
er vom NERV-Sicherheitsdienst aufgegriffen und zurückgebracht wird.

Beim Angriff des sechsten Engels wird Shinji schwer verletzt, als
EVA-01 vom Gegner mit einem Partikelstrahl beschossen wird. Nach der
Bergung des beschädigten Evangelions entwickelt NERV einen Plan, den
Engel, der sich mit einer Art Bohrer langsam zum unterirdisch gelegenen
NERV-Hauptquartier vorarbeitet, mit dem Prototypen einer
Hochleistungs-Positronenkanone zu beschießen. Die hierfür benötigte
Energie soll aus dem gesamten Stromnetz Japans bezogen werden. Zielen
und Abfeuern der Waffe soll Shinji mit EVA-01 übernehmen.

Als sich Shinji jedoch weigert, wieder in den Evangelion zu steigen,
da er sich vor den möglichen Konsequenzen fürchtet, nimmt Misato ihn mit
in die unterste Ebene des NERV-Hauptquartiers und zeigt ihm die dort
gefangene Lilith. Bei ihr handelt es sich um einen weiteren Engel, der
zum Auslöser einer globalen Katastrophe werden könnte, wenn es zum
Kontakt mit einem der angreifenden Engel kommen sollte. Im Jahr 2000
hatte sich mit dem sogenannten Second Impact bereits eine ähnliche Katastrophe ereignet, der die Hälfte der Weltbevölkerung zum Opfer gefallen war. Die Menschheit vor einem Third Impact
zu beschützen, sei die Aufgabe der Evangelions. Vor diesem Hintergrund
willigt Shinji schließlich ein, EVA-01 erneut zu steuern. Im zweiten
Anlauf gelingt es ihm, den Engel zu besiegen.

Zuletzt erwacht der Engel Kaworu Nagisa auf dem Mond. Er spricht mit
einem Vertreter der Geheimorganisation SEELE, die hinter NERV und dem
Evangelion-Projekt steht, über den Vertrag, den die beiden Parteien
geschlossen haben. Kaworu erklärt, dass es sich auf die Begegnung mit
Shinji Ikari freut.